2023年2月

avigan

开个楼。虽然越来越有一种越来越乏善可陈的感觉。

avigan

近期日记， 一是终于看到《良医》第三季了。第三季跟前两季差别比较大，可能是良医第二季看着跟第一季差不多让人觉得有点乏味，所以剧组调整了创作方向。然而，第三季全部围绕着男主的恋爱和性生活展开，有点像青春期成长故事，还是非常美式的那种，偏离前两季的医生职场太远，没啥亮点。
最近热炒AI聊天chatgpt，鉴于过去20年所见新技术发展最后总是走向普通人生活幸福的反面，我对这个热点持保留态度，希望法理管理能先行划定它的许可应用范围和应用限制，并允许公众参与讨论，防止新技术被滥用或者被用于于民不利的方面。

国产科幻《流浪地球2》听说已经开始在海外放映了。鉴于对流浪地球1的印象一般，没深刻思想内涵，然后媒体各种吹看了让人反感，本来对这个2不太感兴趣，但是最近听说纽时恶意攻击流球2，引起了两派大争论，让我有点好奇，一方说很垃圾，另一方说很好看，不知道是感情因素，喜好不同还是影片本身俱有两面性，眼见为实，倒是想去影院验证一下。搜了一下，美国争论归争论，好歹上映了，欧洲这疙瘩还没上映呢，估计是流球2只有英文字幕，没有其他语言版本的字幕，所以没法在欧洲上映，只能等电影下架后在APP上看了。

房东前次问我续不续约，我懒得搬来搬去说愿意续约，最近房东草拟了新合同，说暖气费超预期租金要调高每个月100欧，并且温度限制在白天最高19，晚上最高15，人不在要设到15以下，周四出门大概忘了调温度了，房东直接进了房查看调整了温度，好像还动了我的电线网线之类。新合同看了看，通篇只有租客的义务，没有租客的权利，包括最基本的空间私有。去年刚来觉得讲究人权的文明国度的公民应该知道这些基本规则，所以也没细究。看来人和人纯靠信任还真是不行，还是得靠规则，上哪都一样。

想起美国碰到过的一个私人房东，一个2008年以前买了很多房的人。零下十度的冬天，半夜偷偷把暖气调到把人冻醒，白天暖气也不给足，家里的小金花都冻得叽叽叫，跟他交涉了几次是满嘴fuck，好像他投资房子亏了满世界都欠了他，包不起暖气就不要包，又要收暖气钱又要省暖气费，看到租客还满嘴fuck骂人，这是见过的美国人里面印象最差的，没有之一。看他投资房产亏损心软没让他去出租管理委员会交罚款，现在想想这种人，应该到出租管理委员会那里把他告倒，美国出租屋温度有法律明文规定，罚个3，5千他就老实了。看看现在房东规定的最高温度，还是让人很来气，最高温度甚至不到美国法律规定的最低温度。欧洲的高生活标准被啪啪的打脸了。。

总觉得有点怪怪的，嗯。 再给我搞事情，我也要怒了。

avigan

avigan 发表于 2023-2-5 04:14
近期日记， 一是终于看到《良医》第三季了。第三季跟前两季差别比较大，可能是良医第二季看着跟第一季差不 ...

嗯，又扩大化了， 小局域范围的感受推广到大范围了，算是一种夸张的修辞手法，用来加强某种情绪的表达，主观的，并不客观。这个可以参考李白的诗歌。。 当然，比起李白的诗歌，咱这个还是太朴实了，远远没有那种艺术效果。我在琢磨我这种到底算什么风格，肯定不是李白那种洒脱型的，都是碎碎念。虽然有点朴实，但也不是很犀利，不知道有没有可比的文学流派。

说回价值观，感觉这种俭省的价值观有点像我老爸老妈，但是我老爸老妈对自己俭省，对娃还是大方的，都是求着我开空调我还嫌空调干燥的那种。总体来说，我的价值观肯定跟老一代中国人差别比较大，应该是更偏年轻一代的。怎么说我的知识层次应该是全球1%的水平了，收入可能是30%，但是生活水平好像还不到平均水平，这让我有点不爽。。人到中年，这种落差让我对自己也有点失望。

avigan

不知不觉，夜又深了。一天东拖西拉的，感觉也没干多出多少事，结果就已经困得动摇西晃了。
周末去旅了个游，欧洲出个国还是狠容易的。天气不错，有风也有太阳。比利时的巧克力听说是最棒的，买了小小的两盒，看着非常精致可爱。市中心很多品牌店，30欧的鞋子一排排的，考虑到近期买的那些鞋子出勤率基本为0，我控制了一下。钻石之都，有长长的一溜珠宝店，非常养眼，有些首饰让人看着挪不开眼，更要命的是美女销售笑嘻嘻地指了指减价50%的牌子，有一个非常细巧精致的彩宝排戒，五色光华在射灯下极为璀璨，因其细巧又并不张扬，低调的奢华。盯了一阵没敢问价格，50%的折扣，怕问了就控制不住自己的手。情人节需要买首饰的倒是绝佳的入手时机了。

本来想去钻石中心，结果钻石博物馆闭馆要3月才重开，于是逛了印刷博物馆，世界文化遗产，规模不小，花了两个小时才过了一遍，研究了16世纪的世界地图，跟现今的地图不完全一致，有些差别很有意思。博物馆里很多人物画像，16世纪的油画很成熟了，效果看着就跟拍照似的。仔细计算了那些人的年龄，发现400年前的欧洲人，大部分是60-70左右的寿命，80的狠少，这些人物应该都是当时生活条件不错的吧，看来20世纪人类的寿命确实得到了大幅提升啊，现在平均都80了。博物馆里有些房间是一排排的印刷书，这在当年是富人家才摆得起的吧。当年博览群书是奢侈，如今书都没空看，新闻报道学术论文多得汗牛充栋，一天看多少都不算多，时间不够用。我有点恍惚，不知道如今是幸运的还是当年是幸运的。

就在我趴趴走的当儿，我的谷歌地图经常给我指些莫名其妙的导向，昨天应该走了有十几公里，其中至少1/3是谷歌地图乱指的功劳，我感觉它是一个有自我意志的APP。当然，有自我意志的导航软件也不止谷歌地图一个，高德地图就曾经不动声色地把我导进了连掉头都难的山路，当时我的车上坐着4位博士，都是我同事，不在设想范围的旅途，意外...之喜，受到惊吓的我们竟然非常欢乐，我笑得差点方向盘都握不住了。这次，谷歌地图又立功了，我被导进了一条清冷的巷子，蓦然看见一排红色的橱窗，里面站着衣着极为清凉的女子，上次去探访结果啥也没看见，结果众里寻它总不见，谷歌带你来相逢，话说我看到的都是年轻貌美身材好的呢。虽然好看，不过我没多看，免得太猥琐，毕竟我不是消费人群。

脚走酸了以后，到安特卫普的地标博物馆去遛了遛，听说这个博物馆没一天时间都看不下来，便没进博物馆，直接去了观光顶楼。城市从上空看都差不多，都是密密麻麻的房子，我们很多人引以为豪奋斗一生的毕生财富，从空中看也就是一个灰不溜秋的小方块而已，但却是需要奋斗终身的安身立命之所，哎。。脚酸了，8楼有小方凳子，我便坐在那里晒太阳，远处有一个风筝大师在放风筝，叫他大师不是讽刺是真的牛逼，风筝飞过几十米，在比大楼楼顶更高的天上飘得很稳很自在。在阳光流转中，坐在安特卫普的楼顶，看着远方的人放风筝，这样的下午是不是也算是闲适的一天。

回程有一段是自驾。我的车一直没怎么开高速，太不稳了，一阵风吹过就要吹歪的感觉，我一直对它的状况存在怀疑，又吵又不稳定，感觉是哪里存在状态问题，在完全修正前不想让它跑长途。今天带着车去了4S店，这里的4S店慢得令人发指，等了一个多小时啥都没干成，前次也是，有个传感器哔哔叫个不停，前后去了3次，一次询问啥故障，一次看故障，最后一次修故障，结果修的时候说故障消失了，不用修了，尼玛，这什么鸟车啊，这么神奇。哔哔了一个月，要修了它就不哔哔了。第一次检测说有故障，第二次检测它就没故障了， 感觉有点次。。 今天在那里白白浪费了一个小时，出门开车看到车上赫然多了两坨鸟屎，看来连吃饱了撑着的鸟都看不下去，甩了两坨屎嘲笑我一而再再而三去那浪费时间。

avigan

最近网络安全有点让人揪心。我的outlook mail，有些邮件被莫名删除了，不是我操作的，挺奇怪的。
我的windows系统似乎对无线网有点感冒，它想要断网的时候就给你断网了，而且不是所有设备都断网，有些设备掉线，其他设备依然在线，昨天上网课，我的windows系统被掉线了n次。看起来不是无线网的问题，是操作系统被劫持。
我的手机也不怎么安全，有几次需要闹钟的时候，手机被静音了，好像也不是我操作的，安卓系统。
另外，我的电视，按说它几乎没有互动功能的，似乎也可以被劫持，前些天我打开电视，然后出门倒了个垃圾，走到半路听到我的电视在大声播放音乐。仅仅是开机，没有打开任何节目，这个电视居然自己选了一个歌，并且把音量调到了最大，开始震天响地播放起音乐来。
真是一个可怕的时代。
听说中国要全面数字化了， 保不准是更可怕的时代。
我现在琢磨怎么才能离这些对一般民众而言没有安全隔离屏障的东西远一点。

avigan

土耳其叙利亚地震了，尤其是叙利亚，屋漏偏逢连夜雨啊。

周末趴趴走以后，今天堆积在腿上的乳酸大概都进入血液了，整个人都酸酸软软，连脑瓜子都感觉有点晕乎乎的。晕乎乎其实也挺好，思考能力下降还容易happy，弱智儿童欢乐多。

看到这边教育部呼吁收紧留学生的新闻。我所见的留学生市场有两大板块，一块是要钱的，像英国多是自费留学生，学完就走人，近年英国在这方面也有所转向；一块是要人的，像美国给奖的理工科学生，想留虽看起来难但留下的超80%，当然美国也有很大的自费市场，毕竟美国的教育和科研实力有目共睹。长期以来，美国一直是中国最优秀学生的第一选择，历年清华北大以及第二梯队的科大浙大交大等校学生的留美占大多数。这几年美中关系滑坡，美国接收的少了，中国学生去美也有了些顾虑，对其他国家而言却是机遇期。

avigan

工作研究相关的也写这儿备忘。
NADK，可以转化NAD和NADP的一个激酶，NAD-K，K是kinase，磷酸化激酶，磷酸基团的供体是ATP。
ATP + NAD <-> ADP + NADP
NAD接收磷酸基团后转化成NADP，所以这个酶可以调节NAD/NADH, NADP/NADPH的比例。

这个酶有3个结构域，其中一个域可以结合ATP，一个域可以结合NAD，中间的域可以实现构象变化。组里的老板在蛋白方面很专，近来我对蛋白结构、位点、翻译后修饰相关细节的理解加深了，虽然看起来是不同领域，其实对于建模也有帮助。双底物酶可以有多种反应模式，随机机制、有序机制、乒乓（置换）机制等。这个酶相对还比较新，虽然具体细节机制还不是很清晰，不过根据它的结构，加上以ATP底物的磷酸基团置换功能，我推测它应该属于乒乓机制。不同机制的动力学方程不一样，确定它的反应机制对确定它的动力学方程至关重要。

它的动力学方程需要几个参数，主要是MM常数。经过两天的搜索，找到一篇论述这个酶介导的反应是可逆的文章，文章不仅指出NADK介导的反应是可逆的，而且给出了各个反应物的MM常数， 这篇文章去年9月刚刚见刊，这酶还比较新，能找到它的这些常数真是太幸运了。

这个反应是可逆的，其实并不意外，前几天刚从图书馆借了本书，作者是Atheal Cornish-Bowden，他曾经论证了为什么有些可逆反应会以不可逆的形式出现。从机理上来说，酶促反应都存在可逆的可能，难易问题而已。酶促反应，酶只是发生构象变化，底物和酶结合，酶发生构象变化，然后发生一些传递转移使得底物之间发生重组，生成新的物质，酶释放了生成的物质，反应就完成了， 反应完了它还是原来的它，所以理论上来说逆着走也是可以的，只是逆构象变化很多情况下需要比较多的能量推动，会比较难发生。对于乒乓机制，因为不形成三元复合体，这个机制中的基团转移相对容易，我认为这种机制的酶更容易许可逆向反应。

文章的作者指出NADP，ADP对该反应有抑制作用。我觉得底物对反应有抑制是比较奇怪的，酶的活性也就是它构象变化的推动力为什么会受底物浓度的影响呢？当然，作者有这个结论是观察到了高浓度ADP情况下反应效率发生了变化，从而推测ADP对这个反应有抑制作用。我觉得这个抑制并非是ADP导致的，而是ADP/ATP的比例变化导致的。从动力学角度来看，ATP，ADP之间存在势能差，ATP/ADP比例变化会导致这个势能差变化，从而影响构象变化的难易程度发生变化。NAD-NADP是一样的道理，由于比例变化引起是势能差变化，影响了推动构象变化的反应势能发生变化。

Remdesivir

avigan 发表于 2023-2-8 07:16
工作研究相关的也写这儿备忘。
NADK，可以转化NAD和NADP的一个激酶，NAD-K，K是kinase，磷酸化激酶，磷酸基 ...

哇，看不太懂的样子，这是啥
科普能不能开个新楼，有一种误入的感觉

Remdesivir

avigan 发表于 2023-2-8 05:36
最近网络安全有点让人揪心。我的outlook mail，有些邮件被莫名删除了，不是我操作的，挺奇怪的。
我的wind ...

嚓，人为刀俎，我为鱼肉
网络和电脑安全这块已经没救了，本宝宝也常常觉得不对头
这个世界多了一个大烂疤，偶们没啥办法，跳出来喊过的都被关监狱的关监狱，打倒的打倒，大部分人就像本宝宝一样得过且过
洗洗睡了，偶们这种也没啥秘密的，总有人比偶们更关心这种事

avigan

Remdesivir 发表于 2023-2-9 00:00
哇，看不太懂的样子，这是啥
科普能不能开个新楼，有一种误入的感觉

专业知识，不是科普级别的，我已经写得很简单了，但术语还是免不了的。虽然是建模，但非常需要生物方面的知识，各个层级的，好地模型得尽可能地详尽理解其机理。
一个生物系统包含很多蛋白，每个蛋白都得到这种理解程度才能让模型贴近生物系统，哎，还是担心有遗漏的和未知的知识点，会导致模型在某些时候无法模拟出真实系统。 从目前对生物系统的了解而言，这种情况恐怕是必然会发生的，如何避规或者增加系统的容错度，也是很关键，哎，一边建模一边担心它不够完善。有时候就安慰自己，像当年用电路模拟动作电位建模一样，总得先从简单模型出发，然后拓展到心电图这类相对复杂的，到现在心电图建模都还在不断完善，所以不能操之过急。
不过这些思考还没公开发表，其实我是无所谓，不过是属于工作内容的，不知道合不合适写，我看还是不写了。