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新发了一篇酶分子机制的动力学模型

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发表于 2026-7-23 02:32:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 阿甘左传 于 2026-7-23 02:37 编辑

发在不错的期刊上,抛开期刊不论,这篇文章是我一手操刀,基本没有怎么改的文章,也差不多是我迄今为止最满意的文章。
这篇文章,我一手操办机制推断,模型构建,机制模拟,实验数据拟合验证,没有被迫反复修改,里面绝大部分(95%)以上都是我首稿原话,符合我的原意,与修改十几版仍然不能投或者改得没几句原话通篇不是我想说的那种挫折感相比,这篇更像是确实是-我-在做科研。 也感谢审稿人,意见细节有理,可以合理回复,没有导致稿件需要魔改那种情况。整个过程除了投稿延期了两年以外,其他算是顺利的。一老早我觉得再也不想写鸟毛论文了,如果都是这样,那我还是可以写写文章的。当然,也托原老板老教授的福,老教授有人脉,就像我硕士期间极速发论文,其实得感谢我的硕导。

这篇基于机制推理的纯原创,相信是目前阶段针对这个酶分子最清晰合理的动力学模型,这让我觉得这个文章发表出来是有意义的。它是一个生物机制的数学化,生物分子机制的定量描述。当然,目前最好,不代表完美,我相信肯定是有提高的余地的。这个机制的推理是基于动态捕捉的snap,通过整合大量sanp推断了酶分子机制,然后我根据分子特性用数学来定量描述它的动态过程。在数学化的时候会需要动态过程的参数,这个酶在细胞线粒体内膜处,线粒体内膜的氧化呼吸,有很多动态细节还没有清晰的定量描述 - 题外话,生物极致研究其实还有很多基础点需要填充。本来我想讨论这个点的,这会是一个很精彩的讨论点,后来想想万一我提了这个点以后审稿人要我把这部分也做好,那就麻烦大了。能解决那个动态过程的定量描述的话,完全可以再发一篇很好的文章,而且真正可靠的机制推论最好是有实验支持,这实验还没人做出来,靠纯推理去推出来,感觉以我的能力虽然也有可能,但是我太累了,所以交稿的时候我鸡贼地把这个讨论点删掉了,哈哈哈,感觉我还是很机智的。





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发表于 2026-8-11 00:25:18 | 显示全部楼层
cong~
科研版很久没贴了
但是本宝宝无言以对
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 楼主| 发表于 2026-8-11 04:40:24 | 显示全部楼层
已经提交了一份勘误了。
ln10 x,被印刷成了ln 10x,这个问题有点大,就大部分人读文章的仔细程度,估计会发懵怎么正确解读方程。
模型的核心是方程,只能要求更正了。
大部分时候文章发了我就不看了,一经发表就万事大吉了,其他不管。
这是个好文章,我觉得对目标蛋白酶来说,这是它模型方面的里程碑,所以还是仔细些为好。
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